Interactions complexes entre espèces bactériennes co-existantes dans un environnement: Impact des extraits de végétaux

Abstract

Le tube digestif abrite une communauté complexe de microorganismes appelée le microbiote intestinalqui réside à la surface des muqueuses intestinales tout au long de la vie.Les bactéries entrent en contact avec l’intestin et confèrent d’importantes fonctions indispensables,nutritionnelles, métaboliques et protectrices bénéfiques à l’hôte. Divers facteurs peuvent modifier l'équilibre microbien intestinal. Une dysbiose (modifications dans la composition bactérienne) a été associée à des dysfonctionnements de l’appareil digestif, tels que les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin, le cancer colorectal mais également plus à distance dans l’obésité,le diabète et d’autresmaladies métaboliquesou encoreau moment d'une antibiothérapie.Toutes cespathologiesprovoquent un déséquilibre microbien intestinal qui peut entraîner des symptômes aigus. Une stratégie alternative pour maintenircet équilibre consiste à utiliser des extraits de plantes àactivité prébiotique tout en stimulant les bactéries probiotiques et réduisant la colonisation et la formation de biofilm par les bactéries pathogènes. Leprésent travailvise à caractériser dans un premier temps, le microbiote fécal qui reflète celui de l’intestin chez des patients souffrant de plusieurs pathologiesà savoir le cancer, l’ulcère, le diabète, l’obésité et sous antibiothérapie. Dans un second temps, une étude phytochimiquede la plante Zizyphus lotus, afin de caractériser les différents extraits polyphénoliques(aqueux et méthanolique)etd’étudierin vitro, leurs activités antioxydante,anti-inflammatoireet antibactérienne.Cette étude permetégalementd’évaluerl'effet de cesextraits entant que prébiotique et synergétique(en association avec les probiotiques)sur l'agrégation des probiotiques et l'inhibition des bactéries pathogènes.Les résultats indiquentquelque soit le groupe de patient,le microbiote fécal qui reflète l’intestinalidentifié par la technique MALDI-TOF, est composé d’une communauté bactériennediversifiée regroupant les bactéries bénéfiqueset les pathogènes avec des taux variables selon la pathologie associée au patient. L'analyse phytochimique de différents extraits de Zizyphus lotuspar HPLC-DADa montré que tous les extraits étaientriches en composés phénoliques, de l’ordre de 225,40 mgEAG/gMSpour l'E.AQ et de 63,04 mgEAG/gMSpour l'E.MET. De plus, ilsont desactivitésantioxydanteset anti-inflammatoires importantesde 227 μg/ml pour l'E.AQ et de 195 μg/ml pour l'E.MET, et de 86,8 ± 0,2 %respectivement. Ces extraits ont montré un effet prébiotique avec une activité antibactérienne intéressante. De plus, ces extraits ont un pouvoir prébiotique remarquablequi favorisel’adhésion et l’agrégation des bactéries bénéfiqueset l’inhibitionde la formation de biofilmpar les bactéries pathogènes.